南华大学附属第二医院器官移植中心是中国首批获得卫生部批准开展人体器官移植资质的单位，也是衡阳市唯一具有器官移植资质的单位。1998年成功开展同种异体尸体供肾肾脏移植术，至今已累计完成2000余例；2005年成功开展同种异体亲属供肾肾脏移植术。2006年12月成功开展中国大陆首例ABO血型不相容保留脾脏亲属供肾肾脏移植手术，填补了国内异血型肾脏移植领域的技术空白；2010年9月成功开展中国大陆首例ABO/Rh双血型不相容亲属供肾肾脏移植手术。2014年全面开展DD供肾肾脏移植术；2020年成功开展3D腹腔镜下亲属活体供肾取肾术。2023年7月3日成功开展湘南地区首例“全流程免疫检测+围手术期抗体清除技术助力高致敏肾脏移植”，让“高致敏”肾脏移植受者成功“续航”，填补湘南地区“高致敏”肾脏移植技术空白。2024年1月28日成功开展湖南省首例达芬奇机器人辅助下亲属供肾肾脏移植术，填补了湖南省该领域的技术空白。学科主任李建军教授是我院历史上第一个获得达芬奇机器人手术资质的医师，累计主刀完成各类肾脏移植手术1500余例，尤其是在机器人肾脏移植、高致敏受体、二次移植受体和髂血管闭锁受体等高难度移植手术领域具有丰富的经验，肾脏移植手术成功率、人/肾存活率处于全国领先水平。  

科室独立拥有器官移植重症监护室、VIP康复病房、器官移植实验室、病理实验室和分子实验室等，并设置器官移植一体化门诊，实现器官移植围手术期、术后长期随访全流程精细化管理。配备了国内最先进的第四代达芬奇机器人手术操作系统、ECMO（体外生命支持系统）、BD流式细胞仪、全自动生化分析仪、Luminex2000、Access2免疫分析系统、LifePort（器官灌注运输器）、全自动血液净化器、多功能酶标仪以及全套移植病理检测设备。能常规开展HLA配型、CDC（淋巴细胞毒试验）、FCXM（流式细胞术交叉配型）、PRA（群体反应性抗体）、DSA（供者特异性抗体）、血清药物浓度、淋巴细胞亚群、细胞因子等检查项目。高致敏受者术前常规开展血浆置换、免疫蛋白A吸附等治疗项目。

科室为国家临床重点专科培育项目，是湖南省终末期肾病临床医学研究中心、南华大学器官移植研究所、南华大学附属第二医院终末期肾病临床研究所、衡阳市肾脏移植重点实验室。获评全国优质护理服务病房、湖南省优秀器官移植单位、湖南省工人先锋号。