南华大学附属第二医院病理科，是湖南省“胃癌防治重点实验室”的主要合作科室，是省“乳腺癌、甲状腺癌防治中心”协作科室，2024年，全面通过了国家癌症中心（NCC）组织的肿瘤单病种质控淋巴瘤、甲状腺癌、前列腺癌、乳腺癌、胃癌病理诊断能力验证计划。
  科室占地600余平方，现有正式员工19人，其中硕士研究生14人，在读博士研究生2人。诊断医生10人，其中正高职称1人，副高职称2人，技术员9人，多人具有北京大学医学部病理学系、四川大学华西医学院病理学系进修学习一年的经历。分有两个组织病理诊断组和一个细胞病理诊断组，并且拥有自己的分子病理实验室。曾主持国家自然基金课题两项。科室拥有各类新进设备，价值近千万，可开展组织病理诊断、脱落细胞学诊断、穿刺细胞学诊断、术中冰冻病理诊断、超声空化病理诊断、全自动染色封片术、全自动免疫组化、免疫荧光染色、原位杂交、荧光原位杂交、常规PCR、荧光定量PCR、甲基化检测。在宫颈癌、肠癌、甲状腺癌筛查方面，居于全国领先水平，在胃癌、肠癌、肺癌、乳腺癌、淋巴瘤等肿瘤诊断上，具有丰富的经验。年诊断量3万余例，在全省临床病理诊断领域，占有重要地位。