南华大学附属第二医院药学部经过70余年的发展，目前已形成集药品供应与调剂、临床药学服务、科研与教学于一体的综合性医院药学部门。药学部在新、东院区分别设置门急诊药房、住院药房和药库。临床药学专科为湖南省临床重点专科建设学科，同时还是中国医院药物警戒系统（CHPS）哨点、中华医学会临床药师学员培训中心与国家卫健委紧缺人才药师服务基地、湖南省湖湘高层次人才、消化道肿瘤基础与临床药理研究省重点实验室、衡阳市科协安全合理用药科普基地、衡阳市药学会药物临床评价与研究专业委员会主委、南华大学生药学与药用植物学教研室等多个中心、部门和学术团体的挂靠单位，拥有南华大学附属第二医院临床药学研究所、精准用药与个体化治疗等药学服务平台。

药学部确立了“坚持以病人为中心，开展临床药学研究与实践、努力提高药物治疗水平、保障患者用药安全、促进临床合理用药”的专科发展思路，上线了药房自动化发药机、药品知识库和处方前置审核软件系统，大大提升了药学服务能力。近30名专科临床药师与审方药师的服务覆盖抗感染、抗凝、肿瘤、消化、心血管、内分泌、营养、呼吸与ICU等多个专业方向，目前已形成针对特殊人群和慢病患者用药评价和指导的特色服务模式。

药学部现有药学专业人员85人，其中主任药师3人、副主任药师11人、主管药师30人。硕士生导师4人，已获博士学位者4人、获硕士学位者27人、本科学历52人，7人担任10余个省级以上学术团体副主委、常务委员与委员职务，6人担任近10种中英文学术期刊的编委和审稿人。科室工作用房近3000平方米，配备了药品单剂量分包系统、二维液相色谱仪、GC-MS和LC-MS/MS分析仪、个体化基因测序仪和相关适用的专用设备设施，资产总金额近1000万元，能够覆盖TDM检测、个体化用药相关基因检测、有效化合物筛选及基础研究等临床项目和课题研究。近5年来，药学部共承担各类科学研究项目31项，其中国家自然基金3项、省自等省部级课题14项、其他研究项目14项，发表科研学术论文近100篇、其中SCI期刊论文30余篇，申报专利7项，参编本科教材或学术专著7部。药学部全员在医院“医诚术精、行方智圆”核心价值观的指引下确立了“精药事、笃行进取、追求卓越”的科室文化，全体药学人员秉承全心全意为患者服务的宗旨，为提供优质药学服务不断砥砺前行。